Het archief van de Gereformeerde Gemeente Ommeren omvat slechts enkele stukken. Archiefstukken lijken verloren te zijn gegaan. Het is echter de vraag in hoeverre destijds een ordentelijk archief is bijgehouden. Het voornaamste nog resterende archiefstuk, een register met korte notities van de kerkeraadsvergaderingen en diverse andere aantekeningen, is zeer slordig opgemaakt. De predikaties werden over een aantal jaren druk bezocht, maar het aantal lidmaten bleef gering. Een goede bestaansgrond had de kerk nauwelijks, reden waarom zij in 1876 werd opgeheven. Het is goed mogelijk dat om deze redenen de kerk amper enige centrale administratie heeft bijgehouden, en er van 'verlies' dus geen sprake is.

De resterende stukken zijn terecht gekomen in het archief van de Christelijke Gereformeerde gemeente te Tiel, waar de meeste Ommerense lidmaten zich na opheffing in 1876 bij aansloten. Zij zijn uiteindelijk terecht gekomen op het Streekarchivariaat Tiel-Buren-Culemborg, waar de stukken als gedeponeerd archiefje werden beschreven bij het archief van de Classis Tiel van de Gereformeerde Kerken in Nederland. Deze deponering is niet geheel terecht, omdat de gemeente te Ommeren destijds deel uit maakte van de Classis Arnhem en eigenlijk bij die classis gedeponeerd behoorde te worden. Tegenwoordig vallen Tiel en omgeving (Ommeren) wel onder de Classis Tiel. Deze classis omvat ook de Bommelerwaard. In 1990 droeg het Streekarchivariaat Tiel-Buren-Culemborg het archief van de classis Tiel over aan het Streekarchivariaat Bommelerwaard. In 1993 werd in de Neder-Betuwe een nieuw streekarchivariaat opgericht, waar ook de gemeente Lienden zich bij aansloot. Het dorpje Ommeren behoort tot die gemeente. Op verzoek van het nieuwe Streekarchivariaat KLEM-gemeenten zijn in 1994 de stukken met betrekking tot Ommeren overgedragen aan het genoemde archivariaat. De stukken, oorspronkelijk beschreven onder één inventarisnummer, zijn in 1994 afzonderlijk beschreven.